Malgré le fait que la compilation Super Mario 3D All-Stars n’est officiellement plus disponible sur le Nintendo eShop de la Switch et que la version physique n’est plus commercialisée, Nintendo a décidé de déployer une nouvelle mise à jour (version 1.1.1). Elle ajoute une petite nouveauté assez sympathique : la compatibilité avec la manette Nintendo 64 exclusivement pour Super Mario 64, que seules les personnes abonnées au service Nintendo Switch Online ont pu acheter sur My Nintendo pour 49,99 € (il n’y a plus de stock à l’heure actuelle, mais nul doute qu’il sera renouvelé dans les mois à venir).
Cette manette Nintendo 64 est sans fil et est aux mêmes dimensions que la version d’origine. De plus, certains titres sont déjà jouables avec cette manette, qui apparaît alors comme une manette Nintendo Switch Pro. Toutefois, il peut y avoir quelques complications, puisque les boutons affichés dans Super Mario 64 sur Switch par exemple ne correspondent pas à la manette N64.