Afin de célébrer la sortie de Super Mario Run, Nintendo a trouvé plusieurs façons de promouvoir le jeu, dont une collaboration avec la première application développée avec DeNa sur iOS et Android : Miitomo. Tout d’abord, une offre de lancement est proposée et permet d’obtenir gratuitement 4000 pièces Miitomo supplémentaires en achetant 1000 pièces Miitomo. Jusqu’au 13 janvier 2017 à 04h00, il est possible d’obtenir à nouveau le costume et la casquette Mario ainsi que le costume et la casquette Luigi.
À partir d’aujourd’hui jusqu’au 12 décembre à 15h59, on peut tenter d’obtenir dans Lâche-Mii un papier peint Super Mario Run, un Sol Super Mario Run, un Chapeau Toad, une Tenue de Toad, une Cagoule Bowser, un Costume de Bowser, une Perruque de princesse Peach et une Robe de princesse Peach. Jusqu’à la même date, un Goomba de compagnie, un Boo de compagnie et un Blouson université Super Mario Run sont disponibles dans la boutique Miitomo. Nintendo rappelle aussi que les papiers peints et les sols Miitomo inspirés de Mario sont toujours disponibles. On peut les obtenir en explorant la nouvelle fonctionnalité de messagerie puis en envoyant et en recevant des messages.