Le scénario de ce volet débute peu après les évènements de Professeur Layton et l’Appel du Spectre. Le trio Hershel Layton, Luke Triton et Emmy Altava devra enquêter sur les activités maléfiques du Maître du Masque, qui terrorise la ville et les habitants de Dorémont. Cet individu mystérieux a la capacité de transformer les habitants de Dorémont en statues de pierre. D’après le professeur, le masque que porte ce personnage se nomme le Masque du chaos, ce dernier permettant d’accomplir des miracles grâce à son porteur. Cependant, et malheureusement, le Maître du Masque utilise l’objet mystique afin de produire des catastrophes dans la ville de Dorémont, ce qui terrorise de plus en plus les habitants. Pour résoudre cette affaire étrange, le professeur devra retourner dans un épisode sombre de son passé, où réside donc la solution des problèmes du présent. On incarnera le professeur, alors âgé de 17 ans, dans un passé où ses amis d’enfance ou encore ses parents sont présents. De plus, un tout nouveau mode de jeu fera son apparition lorsque l’on sera dans le passé du professeur, qui permettra d’explorer d’anciennes ruines labyrinthiques, en évitant toutes sortes d’obstacles et d’ennemis. Enfin, trois mini-jeux inédits seront disponibles : le Robot mécanique, le Magasin zinzin et le Théâtre du Capucin.
En attendant sa sortie programmée sur Nintendo 3DS pour le 26 octobre en Europe et le 28 octobre aux États-Unis, vous pouvez visionner juste plus bas trois vidéos de gameplay publiées par le site IGN ainsi que de nombreuses images françaises et quelques artworks des lieux, personnages et cinématiques.